RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 ARMT1Q9H993 441 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SGSM2O43147 1006 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 GPAA1O43292 621 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 MBD4O95243 580 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 LCORLQ8N3X6 602 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 AIDAQ96BJ3 306 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 BAG3O95817 575 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SPDYE6P0CI01 402 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 RHBDL3P58872 404 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 POTECB2RU33 542 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 RAD50Q92878 1312 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 WDR90Q96KV7 1748 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 WNT10BO00744 389 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 USP40Q9NVE5 1235 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SCN4AP35499 1836 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 HACL1Q9UJ83 578 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 PRKAB2O43741 272 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 PLCG2P16885 1265 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 VPS53Q5VIR6 699 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 CERS3Q8IU89 383 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 SEC24BO95487 1268 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 FOXP2O15409 715 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 EPHX2P34913 555 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 TEX11Q8IYF3 940 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 CLRN2A0PK11 232 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 GNAT2P19087 354 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 CACNB3P54284 484 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 PTH1RQ03431 593 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 RRAGCQ9HB90 399 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 FOCADQ5VW36 1801 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 MYO1BO43795 1136 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 NFIAQ12857 509 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 BACH2Q9BYV9 841 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-202ENST00000375429 APPP05067 770 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 USP5P45974 858 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 IDI2Q9BXS1 227 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 REC8O95072 547 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 PICALMQ13492 652 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 MAP4K1Q92918 833 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 VEZTQ9HBM0 779 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 FLT1P17948 1338 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 FGAP02671 866 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-202ENST00000375429 MYH1P12882 1939 aa24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms