RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 LDHCP07864 332 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 BECN1Q14457 450 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 DPF2Q92785 391 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 AIDAQ96BJ3 306 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 MAST3O60307 1309 aa21.55■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 TRAF5O00463 557 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 RABEP1Q15276 862 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 OSBP2Q969R2 916 aa21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CYP7A1P22680 504 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 IL17RAQ96F46 866 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 IL25Q9H293 177 aa21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 GPAA1O43292 621 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 KRT32Q14532 448 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 NECTIN1Q15223 517 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 JAG2Q9Y219 1238 aa21.51■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 M0R2C6 588 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 VEGFBP49765 207 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 GTF2IP78347 998 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PTH1RQ03431 593 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 KCNB2Q92953 911 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 RASSF10A6NK89 507 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PSMA5P28066 241 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MECOMQ03112 1051 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 DACT2Q5SW24 774 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ST18O60284 1047 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 BAG3O95817 575 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 EGFRP00533 1210 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PRDX5P30044 214 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CST9Q5W186 159 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CERS5Q8N5B7 392 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZMYM6O95789 1325 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L3A6NCW0 530 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L4A6NCW7 530 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CHGBP05060 677 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 GRIK5Q16478 980 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF384Q8TF68 577 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.48■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MBD4O95243 580 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 ALX1Q15699 326 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 SNX21Q969T3 373 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 SLC27A2O14975 620 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 PLCG2P16885 1265 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MCM2P49736 904 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 KIF2CQ99661 725 aa21.46■■□□□ 1.03
SYNE4-201ENST00000324444 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 APPP05067 770 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 HSCBQ8IWL3 235 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MRIQ9BWK5 157 aa21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.45■■□□□ 1.02
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