RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 TCP10Q12799 353 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC102AQ96A19 550 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 LARGE1O95461 756 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GSTO1P78417 241 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 SMIM5Q71RC9 77 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ATL3Q6DD88 541 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 RAB34Q9BZG1 259 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP4K1Q92918 833 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 IQGAP1P46940 1657 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 USP17L12C9JPN9 530 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 USP17L21D6R901 530 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GTF3C6Q969F1 213 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 IGKV5-2P06315 115 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM193AP78312 1265 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC181Q5TID7 509 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 COPRSQ9NQ92 184 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GNAT2P19087 354 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 TAF3Q5VWG9 929 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ERCC3P19447 782 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CALML4Q96GE6 196 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM47Q96LD4 638 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE6AP16499 860 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 BRAPQ7Z569 592 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 CUL5Q93034 780 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 STAT6P42226 847 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD40-201ENST00000285243 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 FBXO3Q9UK99 471 aa21.83■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 15.9
ANKRD40-201ENST00000285243 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CENPHQ9H3R5 247 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 HLFQ16534 295 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CYP21A2P08686 494 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 DDIT3P35638 169 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 LETM2Q2VYF4 491 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.082e-13■■□□□ 12.9
ANKRD40-201ENST00000285243 OGFRQ9NZT2 677 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE8BO95263 885 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 USP28Q96RU2 1077 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 HAUS7Q99871 368 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 APBA3O96018 575 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 ASIC1P78348 528 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 ALKQ9UM73 1620 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GTF2IP78347 998 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CHRNDQ07001 517 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 USP8P40818 1118 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 POLA2Q14181 598 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT40Q6A162 431 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GGA1Q9UJY5 639 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 KANK3Q6NY19 840 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 CEP152O94986 1710 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 A0A087WWV3 80 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40-201ENST00000285243 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms