RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-201ENST00000263012 ELP1O95163 1332 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-201ENST00000263012 ATP10DQ9P241 1426 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC96Q2M329 555 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM75PA6NK02 468 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZPR1O75312 459 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TSPY2A6NKD2 308 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM232C9JQI7 657 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 AKR1B10O60218 316 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PTPROQ16827 1216 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PFKFB2O60825 505 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 POLA2Q14181 598 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 BRAPQ7Z569 592 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CDC25AP30304 524 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PLXNC1O60486 1568 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ENC1O14682 589 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MNAT1P51948 309 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 GBP3Q9H0R5 595 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZSCAN26Q16670 478 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 OSBP2Q969R2 916 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ADCY9O60503 1353 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 SOGA3Q5TF21 947 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 SLC5A1P13866 664 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 KRT9P35527 623 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV5-2P06315 115 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 STAT6P42226 847 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 IFT81Q8WYA0 676 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 M0R2C6 588 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 NR5A1Q13285 461 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 POSTNQ15063 836 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 KIF1BO60333 1816 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 CHD1O14646 1710 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP6O43182 974 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 TERF2Q15554 542 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.08■□□□□ 0.81
NOMO3-201ENST00000263012 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.08■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.08■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 ITGA6P23229 1130 aa20.08■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 MAST3O60307 1309 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 FOXN1O15353 648 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 SYNE4Q8N205 404 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 RGS22Q8NE09 1264 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 APPBP2Q92624 585 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 SHTN1A0MZ66 631 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.07■□□□□ 0.8
NOMO3-201ENST00000263012 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms