RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 IGLC1P0CG04 106 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PSG1P11464 419 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 CD1BP29016 333 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HBG1P69891 147 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HBG2P69892 147 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 NMSQ5H8A3 153 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 WDR82Q6UXN9 313 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 RSG1Q9BU20 258 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ST20Q9HBF5 79 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 NRN1Q9NPD7 142 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.02□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 H7C1C5 153 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 GRPP07492 148 aa9.01□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 LCN15Q6UWW0 184 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ZNF596Q8TC21 504 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.01□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.01□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.01□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 H0YJW9 148 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 SSSCA1O60232 199 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 OR10J4P0C629 311 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 LINC00869P0C866 280 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 STAG3L3P0CL85 134 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 CTLA4P16410 223 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PAX9P55771 341 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 KRTDAPP60985 99 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HERV-K104P61576 105 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 FFAR4Q5NUL3 377 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 LCNL1Q6ZST4 164 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 OR11H6Q8NGC7 330 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 CLUHP3Q96NS8 147 aa9□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ATP6V0BQ99437 205 aa9□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.99□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PP6455Q8WZ26 134 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 SFRP2Q96HF1 295 aa8.99□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 NUPR2A6NF83 97 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 CST7O76096 145 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 IGLV3-1P01715 115 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 SEC11AP67812 179 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 GPER1Q99527 375 aa8.98□□□□□ -0.97
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HCG18-241ENST00000602290 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.98□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 H0Y980 276 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 TMEM50AO95807 157 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PRR20EP86478 221 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PRR20CP86479 221 aa8.97□□□□□ -0.97
HCG18-241ENST00000602290 PRR20DP86480 221 aa8.97□□□□□ -0.97
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