RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.53□□□□□ -0.88
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 H3BRN7 92 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 JTBO76095 146 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 CBLN1P23435 193 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ST8SIA2Q92186 375 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 UHRF2Q96PU4 802 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 METTL26Q96S19 204 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 PEMTQ9UBM1 199 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SMPXQ9UHP9 88 aa9.52□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 CHEK1O14757 476 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 BUB3O43684 328 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SPP1P10451 314 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 IGLL1P15814 213 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ORM2P19652 201 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 GLMPQ8WWB7 406 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 MARC2Q969Z3 335 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RABAC1Q9UI14 185 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.51□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 HYPMO75409 117 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV1-51P01701 117 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 OR5G3P0C626 314 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 CD33P20138 364 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RAB2AP61019 212 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF709Q8N972 641 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C17orf77Q96MU5 243 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RNF2Q99496 336 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.5□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 COX7A2P2O60397 106 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SAP30O75446 220 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 NPPCP23582 126 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 LEMD1Q68G75 181 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SLC51BQ86UW2 128 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.49□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF98A6NK75 572 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SSX7Q7RTT5 188 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 BAP18Q8IXM2 172 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 TMED6Q8WW62 240 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 PFDN5Q99471 154 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.48□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SEC11BP0C7V7 166 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 GP9P14770 177 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SERF2P84101 59 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF726P1Q15940 193 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 Q6ZRG5 221 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 RPRMQ9NS64 109 aa9.47□□□□□ -0.89
DNMT1-208ENST00000586667 G3V4G9 280 aa9.46□□□□□ -0.9
DNMT1-208ENST00000586667 M6PRP20645 277 aa9.46□□□□□ -0.9
DNMT1-208ENST00000586667 INSL3P51460 131 aa9.46□□□□□ -0.9
DNMT1-208ENST00000586667 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.46□□□□□ -0.9
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.46□□□□□ -0.9
DNMT1-208ENST00000586667 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.2 ms