RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 SELENOTP62341 195 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 BAXQ07812 192 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF546Q86UE3 836 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 GLMPQ8WWB7 406 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 MGST2Q99735 147 aa14.79□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 HELTA6NFD8 242 aa14.78□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 VWC2Q2TAL6 325 aa14.78□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 ASCL2Q99929 193 aa14.78□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.78□□□□□ -0.04
HLA-B-255ENST00000498007 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 CLINT1Q14677 625 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ATP6V1FQ16864 119 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 STPG3Q8N7X2 389 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 THAP6Q8TBB0 222 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.77□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 FGF7P21781 194 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 CAMLGP49069 296 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RAB31Q13636 194 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ARL6Q9H0F7 186 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A22Q9H936 323 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.76□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 A8MZ25 164 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 HYPMO75409 117 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 OR5G3P0C626 314 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RAP2BP61225 183 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 HSPB11Q9Y547 144 aa14.75□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 LYL1P12980 280 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ASB13Q8WXK3 278 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.74□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 TGP01266 2768 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF98A6NK75 572 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 S100A7P31151 101 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 PLP1P60201 277 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 FGL1Q08830 312 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 MIC13Q5XKP0 118 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 LEMD1Q68G75 181 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 UHRF2Q96PU4 802 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 FBXL17Q9UF56 701 aa14.73□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 H3BRN7 92 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 K7EQG2 157 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 COX7A2P2O60397 106 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 OPCMLQ14982 345 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF124Q15973 351 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 Q5BKY6 102 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 DCANP1Q8TF63 244 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 CITED4Q96RK1 184 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ATP5SQ99766 215 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ARV1Q9H2C2 271 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 NRN1Q9NPD7 142 aa14.72□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF688P0C7X2 276 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.71□□□□□ -0.05
HLA-B-255ENST00000498007 MPDU1O75352 247 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 DEFB131AP59861 70 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 B2MP61769 119 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PRR20EP86478 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PRR20CP86479 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PRR20DP86480 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PRR20BP86481 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PRR20AP86496 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PATE2Q6UY27 113 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 Q6ZRG5 221 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 S100A7AQ86SG5 101 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.7□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 COL7A1Q02388 2944 aa14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 GALR1P47211 349 aa14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 HAGHQ16775 308 aa14.68□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.68□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms