RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF2Q99496 336 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSC22D3Q99576 134 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG5Q9UF02 275 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0J9YWU9 116 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 I3L2K1 104 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFA4O00483 81 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAIN1P0CW23 69 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBPP20226 339 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNCAP37840 140 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETV6P41212 452 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH3B2P48448 385 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RND3P61587 244 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LEMD1Q68G75 181 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1P1Q8NH06 330 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA60Q9H7X0 242 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENY2Q9NPA8 101 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABAC1Q9UI14 185 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE6AA0A183 80 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GU03 582 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4C46A6NHA9 309 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DISC1C4P0D8 188 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTDSPLO15194 276 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSGP08311 255 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF688P0C7X2 276 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 P0C879 139 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKR1C4P17516 323 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCP1P25874 307 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RND2P52198 227 aa3.24□□□□□ -1.89
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIGITQ495A1 244 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCF24Q7RTU0 167 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCFD2Q8NI22 146 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.24□□□□□ -1.89
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RPS3AP54-201ENST00000435535 MARC2Q969Z3 335 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM230Q96A57 120 aa3.24□□□□□ -1.89
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RPS3AP54-201ENST00000435535 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NACAE9PAV3 2078 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BP45 60 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHEK1O14757 476 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB4AO15263 64 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf88P0DMB2 117 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 IAPPP10997 89 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPY1RP25929 384 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOC4P55056 127 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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