RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 DOK5Q9P104 306 aa4.7□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.661e-10■■■■□ 23.6
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01548A6NM66 108 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN4O14817 238 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 ATP6V0E1O15342 81 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 COX7A2P2O60397 106 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 HYPMO75409 117 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFB8O95169 186 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 OR2C1O95371 312 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 IGHG2P01859 326 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 FABP1P07148 127 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PSG1P11464 419 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5G3P48201 142 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 MFAP4P55083 255 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TIGITQ495A1 244 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 FAM209BQ5JX69 171 aa4.69□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 OR4F5Q8NH21 305 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 FXYD5Q96DB9 178 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 OR4F4Q96R69 305 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PARLQ9H300 379 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 THYN1Q9P016 225 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 NAT8Q9UHE5 227 aa4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 CXorf65A6NEN9 183 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 COLCA2A8K830 154 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF727A8MUV8 499 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 H3BUA1 57 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 H3BUX3 64 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 M0R036 132 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TGFAP01135 160 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 CTSGP08311 255 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 RD3LP0DJH9 198 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 GP9P14770 177 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 CFHR3Q02985 330 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 TMEM219Q86XT9 240 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 NECAP1Q8NC96 275 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 Q96MF0 132 aa4.68□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 OR51M1Q9H341 326 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 PITPNC1Q9UKF7 332 aa4.68□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 FOLR2P14207 255 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 IER3P46695 156 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2G2P60604 165 aa4.67□□□□□ -1.66
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 OR5R1Q8NH85 324 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 RNF125Q96EQ8 232 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 UHRF2Q96PU4 802 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 JMJD8Q96S16 334 aa4.67□□□□□ -1.66
C6orf48-208ENST00000395788 FOXC2Q99958 501 aa4.67□□□□□ -1.66
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