RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RNF2Q99496 336 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf66A4D0T2 115 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 M0R2N4 97 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CDS2O95674 445 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGHG4P01861 327 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MGPP08493 103 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL3P19876 107 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 UCP3P55916 312 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PRCDQ00LT1 54 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CD300CQ08708 224 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ICAM4Q14773 271 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1FQ16864 119 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WX48 190 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PGPA6NDG6 321 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FSTL3O95633 263 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MBP02144 154 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB32Q13637 225 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SGK494Q96LW2 274 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf70A6NJV1 201 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA4O00483 81 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SPRY2O43597 315 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 INSP01308 110 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CGB7P0DN87 165 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PSG1P11464 419 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT14Q96FL9 552 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 NRN1Q9NPD7 142 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MED9Q9NWA0 146 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 HSPB11Q9Y547 144 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB3P49720 205 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 DYNLT3P51808 116 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 MLANAQ16655 118 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PRNTQ86SH4 94 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RITA1Q96K30 269 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 SMPXQ9UHP9 88 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGB1BP1O14713 200 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YY99 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12BA1L429 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE7O76087 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12FP0CL80 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12GP0CL81 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE12IP0CL82 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-201ENST00000348564 ODF3BA8MYP8 253 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PAX9P55771 341 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PSG9Q00887 426 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 PAX5Q02548 391 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 SYT8Q8NBV8 401 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TVP23CQ96ET8 276 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 BTF3L4Q96K17 158 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.44□□□□□ -1.86
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