RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	IL20	Q9NYY1	176 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PP11	408 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	SPINK4	O60575	86 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10J4	P0C629	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	RFX2	P48378	723 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCR4	P61073	352 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440		Q0VG73	95 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	CGREF1	Q99674	301 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNAP23-223	ENST00000627440	UBD	O15205	165 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SFTA3	P0C7M3	94 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GZMM	P51124	257 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	MNAT1	P51948	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	STX1B	P61266	288 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GUK1	Q16774	197 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB17	Q9H0T7	212 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	BUB3	O43684	328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG7	O75391	227 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF6B	O95407	300 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT8	P05787	483 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA8	P13928	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DRB3	P79483	266 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZQT7	251 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD9	Q7L273	389 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	NIT1	Q86X76	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A096LNI7	61 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	FABP12	A6NFH5	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM50A	O95807	157 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HRAS	P01112	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SLPI	P03973	132 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B1	P14061	328 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R43	P59537	309 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOB	Q15370	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HES5	Q5TA89	166 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A075B6Q4	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087X002	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	PDCD6	O75340	191 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	CRP	P02741	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	CEL	P19835	753 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	PAFAH1B1	P43034	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN5	P62079	268 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6Q795	121 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	PGP	A6NDG6	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NN06	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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