RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SPP1	P10451	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	MIF	P14174	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1C2	P52895	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ADAP1	O75689	374 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ATG12	O94817	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IFNA17	P01571	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A6	P12236	298 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	C4BPB	P20851	252 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	VAMP1	P23763	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	P2RY1	P47900	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SRPX	P78539	464 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	METTL26	Q96S19	204 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468		X6R8D5	127 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IGLL5	B9A064	214 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PTTG1	O95997	202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IL5	P05113	134 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SPCS3	P61009	180 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468		U3KQE9	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB2A1	O75556	95 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ANXA3	P12429	323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	OPRK1	P41145	380 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IL15RA	Q13261	267 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZTC4	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HOXB5	P09067	269 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ID3	Q02535	119 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	MLANA	Q16655	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HELT	A6NFD8	242 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	AMBP	P02760	352 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	HTR2B	P41595	481 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	OXA1L	Q15070	435 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	RBKS	Q9H477	322 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NXPH3	O95157	252 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A4	P12235	298 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PAX9	P55771	341 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZNX1	250 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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