RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575171.1

NXN-208, Transcript of nucleoredoxin, human

TSL 2

Gene NXN, Length 544 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXN-208	ENST00000575171	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	RAB40C	Q96S21	281 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	NEU1	Q99519	415 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	MED28	Q9H204	178 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NXN-208	ENST00000575171	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CLN5	O75503	358 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	YIF1A	O95070	293 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM50A	O95807	157 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CAV2	P51636	162 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PAX9	P55771	341 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR4X1	Q8NH49	305 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SMIM8	Q96KF7	97 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SMCO3	A2RU48	225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TSC22D2	O75157	780 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CCNK	O75909	580 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CTSG	P08311	255 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	EDN2	P20800	178 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR10J1	P30954	320 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	H2BFS	P57053	126 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TAS2R30	P59541	319 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	FCN2	Q15485	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TIGIT	Q495A1	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	NMES1	Q9C002	83 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZFP92	A6NM28	416 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	LGALS9	O00182	355 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	NDUFA4	O00483	81 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	RLN2	P04090	185 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CSN3	P07498	182 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGLC1	P0CG04	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	GCSH	P23434	173 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IL15RA	Q13261	267 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	GAMT	Q14353	236 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TNC	P24821	2201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM213	A2RRL7	107 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	C2orf70	A6NJV1	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	DEDD	O75618	318 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	FOLR2	P14207	255 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CXCL3	P19876	107 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	INSL3	P51460	131 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171		A8MWP6	167 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PRSS46	E5RG02	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171		E5RGE8	158 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	CST7	O76096	145 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	IGKV1-17	P01599	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	PET100	P0DJ07	73 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	KRTAP10-11	P60412	298 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ARL16	Q0P5N6	197 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	STX12	Q86Y82	276 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171		Q8WTZ3	238 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NXN-208	ENST00000575171	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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