RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484658.1

RAB3GAP2-208, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 4

Gene RAB3GAP2, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LPA	P08519	4548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A0J9YX75	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BUB3	O43684	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SNAPC5	O75971	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GADD45A	P24522	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TALDO1	P37837	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PSMB3	P49720	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ERVK-16	P61578	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LELP1	Q5T871	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q8N814	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SOCS3	O14543	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	EI24	O14681	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NXPH4	O95158	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UCHL1	P09936	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ID1	P41134	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RANBP1	P43487	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB11B	Q15907	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A075B6Q4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		F6UB75	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CORT	O00230	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ADAP1	O75689	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	INS	P01308	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	F2R	P25116	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RASSF2	P50749	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CLDN12	P56749	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ARPC4	P59998	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MUC2	Q02817	5179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KRAS	P01116	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PPY	P01298	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	G6PC	P35575	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ETV6	P41212	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	WNT4	P56705	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TAS2R60	P59551	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ASAH1	Q13510	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q8WTZ3	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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