RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZUT4 128 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 OOSP2Q86WS3 158 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PRR22Q8IZ63 422 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FGFRL1Q8N441 504 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF799Q96GE5 643 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 COQ2Q96H96 371 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 NRTNQ99748 197 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 ZNF747Q9BV97 191 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 PIEZO1Q92508 2521 aa5.84□□□□□ -1.47
PKP4-211ENST00000481115 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.84□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GWB2 263 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 A8MWL6 223 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 RHODO00212 210 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGLV2-8P01709 118 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 CD59P13987 128 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 CRYGSP22914 178 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 GATA3P23771 443 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 FASLGP48023 281 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 MFAP2P55001 183 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SRYQ05066 204 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 C1orf61Q13536 156 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZNF146Q15072 292 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 CARD17Q5XLA6 110 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 MKXQ8IYA7 352 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 Q8TCH9 128 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 RNF138Q8WVD3 245 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 RNF183Q96D59 192 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PRR25Q96S07 402 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZNF492Q9P255 531 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PRO0461Q9UI25 63 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 KNTC1P50748 2209 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JNG1 304 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 MPV17P39210 176 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 TFF3Q07654 80 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 GTF3C1Q12789 2109 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DS5Q14953 304 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 GUSBP1Q15486 140 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 EFNB3Q15768 340 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 FAM27BQ5VT28 67 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 Q6AWC8 147 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZPA2 131 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 NUP35Q8NFH5 326 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 PTH2Q96A98 100 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 LINC01600Q96MT4 127 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 U3KQA8 63 aa5.82□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 ZNF292O60281 2723 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WX48 190 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 C15orf62A8K5M9 175 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGLL5B9A064 214 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 FCN3O75636 299 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 APOMO95445 188 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-12P01611 117 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 CELA2AP08217 269 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SCTP09683 121 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 SPINK2P20155 84 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 EDN2P20800 178 aa5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PKP4-211ENST00000481115 OTX2P32243 289 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms