RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471308.5

PCBP4-208, Transcript of poly(rC) binding protein 4, human

TSL 2

Gene PCBP4, Length 2,087 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP4-208	ENST00000471308	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	ARF6	P62330	175 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NDUFA3	O95167	84 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	AMY1A	P04745	511 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	PRTN3	P24158	256 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308		Q0VG73	95 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NPB	Q8NG41	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	CFHR4	Q92496	578 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PCBP4-208	ENST00000471308	TPPP2	P59282	170 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SPTA1	P02549	2419 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308		A0A1B0GUS0	222 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	PGP	A6NDG6	321 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	PSG1	P11464	419 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308		A0A1B0GV90	55 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TCL1A	P56279	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	RAB4B	P61018	213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	LYZ	P61626	148 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	GNG5	P63218	68 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	GPR82	Q96P67	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	BAGE3	Q86Y29	109 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308		Q9H3A6	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308		K7EIM0	57 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	NUPR1	O60356	82 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SERF1A	O75920	110 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	KLRD1	Q13241	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF124	Q15973	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	IGF2R	P11717	2491 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	ABCA4	P78363	2273 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SPINK4	O60575	86 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TOMM40	O96008	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	RNF224	P0DH78	156 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SFTPC	P11686	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	LINC00310	P59036	64 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	TCRA	P04437	139 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SLC35B1	P78383	322 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	HES1	Q14469	280 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PCBP4-208	ENST00000471308	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1191.8 ms