RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	WRB	O00258	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IFNA4	P05014	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q8WTZ3	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	METTL26	Q96S19	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		I3L2K1	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		K7EIM0	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CTSG	P08311	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NPPC	P23582	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NPY1R	P25929	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	APOC4	P55056	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	HELT	A6NFD8	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSPAN4	O14817	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	CLN5	O75503	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC25A6	P12236	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYL1	P12980	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM187	Q14656	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550		V9GYH0	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2C	O00762	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	SFT2D2	O95562	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM50A	O95807	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	HOXB5	P09067	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550		P0C879	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10J1	P30954	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	RND2	P52198	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	MFAP2	P55001	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	HAGH	Q16775	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SH3BGR-208	ENST00000452550	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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