RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391002.1

SNORD12-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12-201ENST00000391002 XAGE1AQ9HD64 81 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 BIN3Q9NQY0 253 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 FKBP11Q9NYL4 201 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CKLFQ9UBR5 152 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 V9GYQ6 96 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CEP164Q9UPV0 1460 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 NAV1Q8NEY1 1877 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TECPR2O15040 1411 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 NCOA1Q15788 1441 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SVILO95425 2214 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 THADAQ6YHU6 1953 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 MAST2Q6P0Q8 1798 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 GLI3P10071 1580 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RTL1A6NKG5 1358 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 DSCAML1Q8TD84 2053 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 NUP205Q92621 2012 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 LTBP2Q14767 1821 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 C5orf67F2Z3F1 127 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 LYZL6O75951 148 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TCL1BO95988 128 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 IFI30P13284 250 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 OGNP20774 298 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 S100GP29377 79 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SDC4P31431 198 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RAB5CP51148 216 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TCTAP57738 103 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 ROMO1P60602 79 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RTL8BQ17RB0 113 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SPRNQ5BIV9 151 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 C1orf140Q5VVS0 124 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 Q5XG85 94 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 C22orf39Q6P5X5 142 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF826PQ6ZT77 177 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 Q8N2B8 174 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 LINC00311Q8N616 119 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 Q8N814 137 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 OR4D11Q8NGI4 311 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 OR2T10Q8NGZ9 312 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PPTC7Q8NI37 304 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 THEM6Q8WUY1 208 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TEX37Q96LM6 180 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 GPER1Q99527 375 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RTL8AQ9BWD3 113 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 REG4Q9BYZ8 158 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 IMUPQ9GZP8 106 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CST9LQ9H4G1 147 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 POPDC3Q9HBV1 291 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TAS2R7Q9NYW3 318 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SYNMO15061 1565 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 ATRXP46100 2492 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 OTOFQ9HC10 1997 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 C9orf170A2RU37 121 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TLCD2A6NGC4 264 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CCDC160A6NGH7 325 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 H3BQV1 296 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 M0R129 80 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 RER1O15258 196 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 UBL3O95164 117 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 MT-ND6P03923 174 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 TFF1P04155 84 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 FABP2P12104 132 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 HBBP68871 147 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PSPHP78330 225 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 CDK5R1Q15078 307 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 BCL2L15Q5TBC7 163 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 SAMD13Q5VXD3 122 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 PRR15Q8IV56 129 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD12-201ENST00000391002 LINC00301Q8NCQ3 95 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.3 ms