RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 A8MU10 97 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 OR2J2O76002 312 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SOD1P00441 154 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BOP23527 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 S100GP29377 79 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SRIP30626 198 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BBP33778 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 CSN1S1P47710 185 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BDP58876 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP10-12P60413 245 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BCP62807 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HTR4Q13639 388 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 RHEBQ15382 184 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SERPINI1Q99574 410 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 DERL1Q9BUN8 251 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TET1Q8NFU7 2136 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 NACAE9PAV3 2078 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 LEPROTO15243 131 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ARPC5O15511 151 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SCGB1A1P11684 91 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TAS2R20P59543 309 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 LTC4SQ16873 150 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 C2orf50Q96LR7 162 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.51□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 AIPO00170 330 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 DHFRP00374 187 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HMGN1P05114 100 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PIGPP57054 158 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MOBPQ13875 183 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 EBI3Q14213 229 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ZNF675Q8TD23 568 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MND1Q9BWT6 205 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 RNF122Q9H9V4 155 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HSPB11Q9Y547 144 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.5□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TRIP11Q15643 1979 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 MYH7BA7E2Y1 1941 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 GGTLC3B5MD39 225 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 IFNA7P01567 189 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ALDH3A1P30838 453 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PSMD8P48556 350 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 PPTC7Q8NI37 304 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 AICDAQ9GZX7 198 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 Q9Y3F1 56 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 NUP205Q92621 2012 aa3.49□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.48□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.48□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.48□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.48□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 IFNA10P01566 189 aa3.48□□□□□ -1.85
MDM2-201ENST00000258148 LPAR6P43657 344 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms