RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		8.54	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		8.54	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK11	Q9UBX7	282 aa		8.54	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BMM0	161 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	NXPH3	O95157	252 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	CD74	P04233	296 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	CD3D	P04234	171 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	UCP1	P25874	307 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	DHODH	Q02127	395 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM16L	Q309B1	348 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	AARD	Q4LEZ3	155 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF575	Q86XF7	245 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	ENY2	Q9NPA8	101 aa		8.53	□□□□□ -1.04
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB2A1	O75556	95 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	IL4	P05112	153 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DRB4	P13762	266 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10J1	P30954	320 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZR54	194 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52I2	Q8NH67	350 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NRN1	Q9NPD7	142 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		8.52	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	BUB3	O43684	328 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG12	O94817	140 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR2B	P41595	481 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	EMP1	P54849	157 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FXYD7	P58549	80 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SPCS3	P61009	180 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	VBP1	P61758	197 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf83	Q53S99	150 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8WTZ3	238 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	COPZ2	Q9P299	210 aa		8.51	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3-20	P01619	116 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5AC1	P0C628	307 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF709	Q8N972	641 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52E5	Q8NH55	327 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ACY3	Q96HD9	319 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NEU1	Q99519	415 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG5	Q9UF02	275 aa		8.5	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CDS2	O95674	445 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TOMM40	O96008	361 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A4	P12235	298 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NPY1R	P25929	384 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MEF2D	Q14814	521 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM219A	Q8IW50	185 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TERB2	Q8NHR7	220 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NPIPB3	Q92617	1050 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR146	Q96CH1	333 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD1	Q96SE0	405 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	DKK2	Q9UBU2	259 aa		8.49	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM25A	B3EWG3	89 aa		8.48	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM25C	B3EWG5	89 aa		8.48	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM25G	B3EWG6	89 aa		8.48	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNA10	P01566	189 aa		8.48	□□□□□ -1.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PSG1	P11464	419 aa		8.48	□□□□□ -1.05

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