RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-209	ENST00000559551	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	IFNA5	P01569	189 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	FHIT	P49789	147 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	GAMT	Q14353	236 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	NF1	P21359	2839 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551		G3V318	75 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	FGF7	P21781	194 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	MGST2	Q99735	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551		I3L2K1	104 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SOX15	O60248	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	YIF1A	O95070	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		K7EIM0	57 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	LY6G6D	O95868	133 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGHG2	P01859	326 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OPRK1	P41145	380 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFA6	P56556	154 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		H3BQ15	152 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	MT-CO2	P00403	227 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	DOK5	Q9P104	306 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TGOLN2	O43493	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	DEFA4	P12838	97 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551		S4R3C0	116 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RABGGTA-209	ENST00000559551	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62

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