RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533400.5

CASP1-215, Transcript of caspase 1, human

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP1-215	ENST00000533400	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	CA2	P00918	260 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	LIF	P15018	202 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	P2RX1	P51575	399 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	TAS2R46	P59540	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	HES1	Q14469	280 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	MAL2	Q969L2	176 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	BMF	Q96LC9	184 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	RERGL	Q9H628	205 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASP1-215	ENST00000533400	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	EDIL3	O43854	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	IGHM	P01871	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CFP	P27918	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ATP4B	P51164	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	HERVK_113	P63121	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	AMELY	Q99218	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	MYLK	Q15746	1914 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	SOCS1	O15524	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TNFSF12	O43508	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	PROSC	O94903	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	LINC00869	P0C866	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	RND3	P61587	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400		A0A1W2PPM0	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400		J3QQQ9	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	OVOL1	O14753	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	NMU	P48645	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	SLC25A1	P53007	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	GNB2	P62879	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZFAND5	O76080	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	NUDT14	O95848	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400		P01737	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ELK1	P19419	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	KLK2	P20151	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	CCR2	P41597	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	PPP1CA	P62136	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP1-215	ENST00000533400	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms