RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	MPTX1	A8MV57	137 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424		L7N2F9	121 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA4	O00483	81 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SSNA1	O43805	119 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-48	P01763	117 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CD81	P60033	236 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP2	P63027	116 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CCS	O14618	274 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SSSCA1	O60232	199 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CLN5	O75503	358 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	YIF1A	O95070	293 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSG	P08311	255 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM8	Q96KF7	97 aa		12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM50A	O95807	157 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R30	P59541	319 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS21	Q2M5E4	152 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CASC10	Q5T4H9	136 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		12.98	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf62	A8K5M9	175 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H12	B2RN74	326 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RLN2	P04090	185 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP1	P07148	127 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	LYL1	P12980	280 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	BMI1	P35226	326 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	MLX	Q9UH92	298 aa		12.97	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424		F8W735	103 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	GOSR2	O14653	212 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	CD7	P09564	240 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RND2	P52198	227 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	MLANA	Q16655	118 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCA2B	Q16661	112 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TM4SF20	Q53R12	229 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17D	Q8TAD2	202 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN4	O14817	238 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TSC22D2	O75157	780 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	CD5	P06127	495 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10J1	P30954	320 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	ADM	P35318	185 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8WTZ3	238 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RYR3	Q15413	4870 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BP45	60 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAP31	P51572	246 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A10	P60903	97 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	BTNL8	Q6UX41	500 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	NMES1	Q9C002	83 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf66	A4D0T2	115 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EPK0	472 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	GAMT	Q14353	236 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TIGIT	Q495A1	244 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HDAC10-216	ENST00000489424	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.92	□□□□□ -0.34

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