RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 GPR146Q96CH1 333 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 K7EQG2 157 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 ZNF688P0C7X2 276 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SPP1P10451 314 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 RND2P52198 227 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 DEFB4AO15263 64 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 NXPH3O95157 252 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 OR10J1P30954 320 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 DHRS2Q13268 280 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SPCS2Q15005 226 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 AARDQ4LEZ3 155 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 GPR132Q9UNW8 380 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CTDSPLO15194 276 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 IFNA10P01566 189 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1-17P01599 117 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 NPY1RP25929 384 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 IGLC1P0CG04 106 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 ALDH3B2P48448 385 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 IL22RA2Q969J5 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 MCUBQ9NWR8 336 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 KNCNA6PVL3 124 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 IL4P05112 153 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 ANXA3P12429 323 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 TCTAP57738 103 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 ACY3Q96HD9 319 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 C11orf94C9JXX5 98 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 RD3LP0DJH9 198 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 MIFP14174 115 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 DCANP1Q8TF63 244 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 NPIPB3Q92617 1050 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 U3KQ87 197 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 AKR1C4P17516 323 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 CCR6P51684 374 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 TMBIM6P55061 237 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 PSMG4Q5JS54 123 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 U3KQE9 123 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 FABP12A6NFH5 140 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 TOMM40O96008 361 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SRPXP78539 464 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SMCO1Q147U7 214 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 LGI3Q8N145 548 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 DTD1Q8TEA8 209 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 GLMPQ8WWB7 406 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 RAB40CQ96S21 281 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 HRH4Q9H3N8 390 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 PRR13Q9NZ81 148 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 A0A0B4J2A0 478 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 IGLL5B9A064 214 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 DEDDO75618 318 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 NMSQ5H8A3 153 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 Q8NAQ8 132 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 OR1S1Q8NH92 325 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 AGRNO00468 2067 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 RBKSQ9H477 322 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 NRN1Q9NPD7 142 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-212ENST00000484841 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms