RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD177Q8N6Q3 437 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0G2JRQ6 117 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TREML4Q6UXN2 200 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1QL4Q86Z23 238 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR82Q96P67 336 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPFP49454 3210 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL19Q99731 98 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PMCHL2Q9BQD1 86 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZRM9 215 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMM23O14925 209 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTURNQ8N3F0 131 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C7orf69Q9H7B7 122 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REG4Q9BYZ8 158 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.72□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf16Q68DN1 1984 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U3KQA8 63 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXCL1P09341 107 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLRX5Q86SX6 157 aa13.71□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00473A8K010 186 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBR2O15453 112 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRCDQ00LT1 54 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDS2Q8NDY4 140 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DERL1Q9BUN8 251 aa13.71□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB9AP51151 201 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC32Q5I0X7 151 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COLCA2A8K830 154 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF600Q6ZNG1 722 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRELID3AQ96N28 172 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLNRO43193 412 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERPUD1Q15011 391 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF56Q15929 161 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REC114Q7Z4M0 266 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COQ2Q96H96 371 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H4GQ99525 98 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.7□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6HO94772 140 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM160Q9NX00 188 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFAP01135 160 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEPN1Q6WQI6 88 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.69□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R60P59551 318 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADIPOQQ15848 244 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERASQ7Z444 233 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM168AQ92567 244 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADMP35318 185 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLMPQ8WWB7 406 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF125Q96EQ8 232 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNLZQ5SXM8 178 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX38Q6PEX7 206 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYT8Q8NBV8 401 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.68□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OBSL1O75147 1896 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMP3P35625 211 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6P435 159 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRN1Q9NPD7 142 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.67□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPDR1Q9UM22 224 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYSFO75923 2080 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GV72 72 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLANAQ16655 118 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms