RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF20P17024 532 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TSKUQ8WUA8 353 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RPRMQ9NS64 109 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RABAC1Q9UI14 185 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OPRK1P41145 380 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2G1P62253 170 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 BORCS8Q96FH0 119 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SPACA5Q96QH8 159 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NSG2Q9Y328 171 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf70A6NJV1 201 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ESM1 405 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNB1O43157 2135 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9G9P0C7N8 305 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL16Q0P5N6 197 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SCAMP4Q969E2 229 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 FCN1O00602 326 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RRHO14718 337 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RENP00797 406 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 IGF1P05019 195 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6Q795 121 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8B2Q96RD0 313 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OTORQ9NRC9 128 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GTH9 108 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf61A6NNL5 157 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf97H3BN30 126 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGN4O00479 90 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PI3P19957 117 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 EFEMP1Q12805 493 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EMT4 169 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF90Q03938 601 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NABP1Q96AH0 204 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NAA60Q9H7X0 242 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MWL6 223 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 H7C1H1 209 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL21O00585 134 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 STK17BO94768 372 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 NAPSAO96009 420 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF1P05230 155 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CD7P09564 240 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CTLA4P16410 223 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN2P57739 230 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 LCN10Q6JVE6 187 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 MLST8Q9BVC4 326 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF688P0C7X2 276 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGDSP41222 190 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WWL8 130 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R2P5 195 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-202ENST00000380828 DPTQ07507 201 aa5.49□□□□□ -1.53
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