RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AP1S3Q96PC3 154 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EURLQ9NYK6 297 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NDUFAF4Q9P032 175 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SS18L2Q9UHA2 77 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMED7Q9Y3B3 224 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLIP1P30622 1438 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIC1Q4ADV7 1423 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MED23Q9ULK4 1368 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1B0GW64 132 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB19A4D1S5 217 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A6NLC8 198 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYCE1LA8MT33 242 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C9JCJ5 164 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 E7EUB6 86 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HCRTR2O43614 444 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR1F1O43749 312 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZWINTO95229 277 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LYPLA2O95372 231 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IVLP07476 585 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HBQ1P09105 142 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HLA-DPA1P20036 260 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SDC4P31431 198 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR1D2P34982 312 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CD151P48509 253 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNAJB13P59910 316 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VBP1P61758 197 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CETN1Q12798 172 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNX1Q13596 522 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAPK6Q16659 721 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HFEQ30201 348 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C12orf60Q5U649 245 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HACD4Q5VWC8 232 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SFXN4Q6P4A7 337 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OFCC1Q8IZS5 231 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR7G2Q8NG99 324 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR8J3Q8NGG0 315 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR151Q8TDV0 419 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLAMF6Q96DU3 332 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C12orf66Q96MD2 445 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDRG1Q9NUG6 133 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKRD36A6QL64 1941 aa-3.47□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TET3O43151 1660 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRDCB7Z8K6 153 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STX16O14662 325 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PMM2O15305 246 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DIRAS1O95057 198 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKCP01834 107 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBP1P09467 338 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GGT1P19440 569 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FDFT1P37268 417 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP2R5AQ15172 486 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC184Q52MB2 194 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTSL3PQ5NE16 218 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPM1LQ5SGD2 360 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPATA19Q7Z5L4 167 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRARPQ7Z6K4 114 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKRD37Q7Z713 158 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM17Q86X19 198 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EFCAB13Q8IY85 973 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EXOC8Q8IYI6 725 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC37A2Q8TED4 501 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BIRC8Q96P09 236 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTMR9Q96QG7 549 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TPPP3Q9BW30 176 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATG5Q9H1Y0 275 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARV1Q9H2C2 271 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBKSQ9H477 322 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PFDN2Q9UHV9 154 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms