RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 LCN2P80188 198 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM86BQ8N661 226 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 DPM3Q9P2X0 92 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 CGB1A6NKQ9 187 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 MARCH11A6NNE9 402 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 C9JQL5 133 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 RND2P52198 227 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 PAX2Q02962 417 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM186Q96B77 213 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 LIME1Q9H400 295 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 RRHO14718 337 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 DKK1O94907 266 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 PLNP26678 52 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GAGE2BQ13066 116 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GAGE2EQ4V326 116 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GGACTQ9BVM4 153 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 UTRNP46939 3433 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 HEPN1Q6WQI6 88 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZSR3 168 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 ODAMA1E959 279 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 FAM27E3Q08E93 113 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 MGST2Q99735 147 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PRX2 142 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 CTAG1AP78358 180 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 C1QL4Q86Z23 238 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 JPT1Q9UK76 154 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 PSG7Q13046 419 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 C10orf142B7Z368 130 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 SIGMAR1Q99720 223 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 SPANXA1Q9NS26 97 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 C9JCJ5 164 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00614P0C842 121 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRG-201ENST00000295874 MYOD1P15172 320 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 VENTXO95231 258 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 GPR183P32249 361 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 CALYQ9NYX4 217 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 HCP5Q6MZN7 132 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 PCDH15Q96QU1 1955 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 CDKN1AP38936 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 FXYD3Q14802 87 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ATXN8Q156A1 80 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 C17orf98A8MV24 154 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 MALP21145 153 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1B0GW15 77 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 A8MWV9 139 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 Q6AWC8 147 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV1-2P23083 117 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF146Q15072 292 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 RNF182Q8N6D2 247 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 CELA3BP08861 270 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 ATOH7Q8N100 152 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 SRD5A1P18405 259 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 CRYBB3P26998 211 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRG-201ENST00000295874 PCNX3Q9H6A9 2034 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms