RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 WDR86Q86TI4 376 aa8.34□□□□□ -1.07
CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A45Q8N413 288 aa8.34□□□□□ -1.07
CLDN1-201ENST00000295522 C18orf15Q96N68 181 aa8.34□□□□□ -1.07
CLDN1-201ENST00000295522 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLDN1-201ENST00000295522 CEP250Q9BV73 2442 aa8.34□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 F2RL2O00254 374 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 VWC2LB2RUY7 222 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 C21orf140B9A014 251 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 CFIP05156 583 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 ACP1P24666 158 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 PLGLB1Q02325 96 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.33□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 PKIBQ9C010 78 aa8.33□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 APELAP0DMC3 54 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 SFTA2Q6UW10 78 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 Q8TCH9 128 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 WFDC2Q14508 124 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 COQ2Q96H96 371 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 C1orf159Q96HA4 380 aa8.32□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.32□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 MDP1Q86V88 176 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 NXPH1P58417 271 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 PCOLCEQ15113 449 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 SPINK14Q6IE38 97 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.31□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 A0A1W2PR77 199 aa8.31□□□□□ -1.08
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CLDN1-201ENST00000295522 A0A1W2PRF3 423 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 A0A1W2PRM7 423 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 PSMB11A5LHX3 300 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 SLC25A17O43808 307 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 FAM87AP0C7U9 286 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 MC5RP33032 325 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 PRNTQ86SH4 94 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 MBD6Q96DN6 1003 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 hADV38S2A0JD32 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CLDN1-201ENST00000295522 H3BMG7 143 aa8.3□□□□□ -1.08
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