RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 THYN1Q9P016 225 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HMSDA8MTL9 139 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX22C9J3V5 150 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 E7EUB6 86 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 H0YIZ8 118 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CORTO00230 105 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 REG1AP05451 166 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 AREGP15514 252 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 C4BPBP20851 252 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HBG1P69891 147 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HBG2P69892 147 aa8.93□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 BAXQ07812 192 aa8.93□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF126Q9BV68 326 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 MFFQ9GZY8 342 aa8.93□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GVY2 172 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CGB1A6NKQ9 187 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 IGF1P05019 195 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.92□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf83Q53S99 150 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 STPG2Q8N412 459 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 LILRB2Q8N423 598 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF114Q8NC26 417 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5T1Q8NG75 326 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1P1Q8NH06 330 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.92□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0D9SG52 128 aa8.91□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.91□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 CTRB1P17538 263 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OPRK1P41145 380 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 PAX9P55771 341 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2F1Q13607 317 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 MISP3Q96FF7 219 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 AQP10Q96PS8 301 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 P2RX4Q99571 388 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF580Q9UK33 172 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 C15orf62A8K5M9 175 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 G3V318 75 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 G3V3Q6 166 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CST7O76096 145 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM50AO95807 157 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYGCP07315 174 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 S100A11P31949 105 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF345Q14585 488 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZS46 218 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4C12Q96R67 309 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPB11Q9Y547 144 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 IGSF23A1L1A6 192 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 SMCO3A2RU48 225 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMB11A5LHX3 300 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BUA1 57 aa8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.89□□□□□ -0.99
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