RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JLM5 398 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF883P0CG24 379 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-211ENST00000580170 OR10J3Q5JRS4 329 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRM-211ENST00000580170 LTBRP36941 435 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRM-211ENST00000580170 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.72■□□□□ 0.43
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