RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TMEM128Q5BJH2 165 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 LGI3Q8N145 548 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 DUSP18Q8NEJ0 188 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CEBPZOSA8MTT3 80 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TSPAN4O14817 238 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 OPRK1P41145 380 aa13.26□□□□□ -0.29
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CS-219ENST00000550655 SMCO1Q147U7 214 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 MLANAQ16655 118 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 ANKRD55Q3KP44 614 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 C2orf83Q53S99 150 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SLC24A4Q8NFF2 622 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.26□□□□□ -0.29
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CS-219ENST00000550655 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SMPXQ9UHP9 88 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 DNAH7Q8WXX0 4024 aa13.25□□□□□ -0.29
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CS-219ENST00000550655 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TRIQKQ629K1 86 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 LRTM2Q8N967 370 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 OR4X1Q8NH49 305 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CHEK1O14757 476 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CLN5O75503 358 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 VAMP1P23763 118 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 PPP1R1AQ13522 171 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 ZNF600Q6ZNG1 722 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SPATA25Q9BR10 227 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GU03 582 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SFT2D2O95562 160 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 NPY1RP25929 384 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 BTCP35070 178 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 CITED4Q96RK1 184 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RNF2Q99496 336 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RBKSQ9H477 322 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 NAP1L6A6NFF2 107 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 PITX3O75364 302 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 NDUFB6O95139 128 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 IGKV1-17P01599 117 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 IL7P13232 177 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 DTD1Q8TEA8 209 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 GINS3Q9BRX5 216 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RETNQ9HD89 108 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 INPP1P49441 399 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 PRSS54Q6PEW0 395 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 OR1S1Q8NH92 325 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 VSIRQ9H7M9 311 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa13.2□□□□□ -0.3
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CS-219ENST00000550655 SLC25A6P12236 298 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 RND2P52198 227 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 TIGITQ495A1 244 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ST8SIA2Q92186 375 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 UBQLN2Q9UHD9 624 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 OR4C46A6NHA9 309 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 LILRB2Q8N423 598 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 TMED3Q9Y3Q3 217 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 U3KQ87 197 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 C9orf170A2RU37 121 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 IFNA10P01566 189 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 NOXA1Q86UR1 476 aa13.18□□□□□ -0.3
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