RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCSHP23434 173 aa13.78□□□□□ -0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRTM2Q8N967 370 aa13.78□□□□□ -0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf144Q96I85 54 aa13.78□□□□□ -0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.78□□□□□ -0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C15orf61A6NNL5 157 aa13.78□□□□□ -0.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.78□□□□□ -0.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-11P01762 117 aa13.77□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSG9Q00887 426 aa13.77□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAXQ9Y2V3 346 aa13.77□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1-5P01602 117 aa13.76□□□□□ -0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.76□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.76□□□□□ -0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GALT5-AS1P59052 145 aa13.75□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.75□□□□□ -0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.74□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00587B1AMM8 73 aa13.74□□□□□ -0.21
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLX6P56179 175 aa13.74□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.74□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf204Q6ZNR8 217 aa13.74□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q9H3A6 140 aa13.74□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6DQ14210 128 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM42Q69YG0 159 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERF1AO75920 110 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYOD1P15172 320 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBA4BQ9H853 241 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GUT8 65 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX6CP09669 75 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD69Q07108 199 aa13.73□□□□□ -0.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
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