RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CORT	O00230	105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	NPBWR1	P48145	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF79	Q15937	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	YIF1A	O95070	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A1B0GU03	582 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	HTR2B	P41595	481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CLN5	O75503	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	LILRB2	Q8N423	598 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A0B4J2A0	478 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	AKR1C4	P17516	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	OPRK1	P41145	380 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	RYR2	Q92736	4967 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	AP3S2	P59780	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	NXPH3	O95157	252 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	S100A5	P33763	92 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	CCR6	P51684	374 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SNHG12-208	ENST00000481220	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	CD5	P06127	495 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	CRYBB3	P26998	211 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	SRPX	P78539	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF124	Q15973	351 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	TIGIT	Q495A1	244 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220		Q6ZWC4	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	LGI3	Q8N145	548 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	PITX3	O75364	302 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	DFFB	O76075	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC25A4	P12235	298 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ANXA3	P12429	323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	NPPC	P23582	126 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	APOC4	P55056	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG12-208	ENST00000481220	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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