RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GU03 582 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 GNG7O60262 68 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM50AO95807 157 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OPRK1P41145 380 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 INPP1P49441 399 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CD81P60033 236 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf83Q53S99 150 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB125Q8N687 156 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OR10C1Q96KK4 312 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NEURL2Q9BR09 285 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf170A2RU37 121 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf62A8K5M9 175 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 MPTX1A8MV57 137 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 K7EMT4 169 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 HOXB5P09067 269 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 HTR2BP41595 481 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SRPXP78539 464 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 LILRB2Q8N423 598 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OR4X1Q8NH49 305 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 MARC2Q969Z3 335 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 SMPXQ9UHP9 88 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 U3KQK5 164 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.04□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CORTO00230 105 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CHEK1O14757 476 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CLN5O75503 358 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 ADAP1O75689 374 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 YIF1AO95070 293 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1-17P01599 117 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OR4E1P0C645 316 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NPY1RP25929 384 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 NPBWR1P48145 328 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DHRS2Q13268 280 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 TIGITQ495A1 244 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 OR1S1Q8NH92 325 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 DTD1Q8TEA8 209 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 CITED4Q96RK1 184 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 RNF2Q99496 336 aa8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 OR11H12B2RN74 326 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 LYRM1O43325 122 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 IGLC1P0CG04 106 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 IAPPP10997 89 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 HAGHQ16775 308 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 ST8SIA2Q92186 375 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.02□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 CENPXA8MT69 81 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN4O14817 238 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 IFNA10P01566 189 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A6P12236 298 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 RND2P52198 227 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 LYG2Q86SG7 212 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 RCHY1Q96PM5 261 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TUBA4BQ9H853 241 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 U3KQ87 197 aa8.01□□□□□ -1.13
ATG4B-210ENST00000428861 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8□□□□□ -1.13
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