RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 M0R3E3 92 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CCL2P13500 99 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 EFNA4P52798 201 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IL15RAQ13261 267 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM141Q96I45 108 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 FOXE3Q13461 319 aa5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.9□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 TREML4Q6UXN2 200 aa5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SPRED2Q7Z698 418 aa5.9□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2L6O14933 153 aa5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.89□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.89□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 NIT1Q86X76 327 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 K7EM74 188 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BOP23527 126 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BBP33778 126 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BDP58876 126 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BCP62807 126 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 Q5BKY6 102 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H4GQ99525 98 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 AMN1Q8IY45 258 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.88□□□□□ -1.47
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ALMS1-201ENST00000423048 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.88□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 EPOPA6NHQ4 379 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SELLP14151 372 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 KLK2P20151 261 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 SPXQ9BT56 116 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 PRO1933Q9H354 126 aa5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.87□□□□□ -1.47
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