RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 IAPPP10997 89 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 CX3CL1P78423 397 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SPINK9Q5DT21 86 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 DCUN1D4Q92564 292 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PARP11Q9NR21 331 aa8.99□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 CHST1O43916 411 aa8.98□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 IFNA10P01566 189 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SNCAP37840 140 aa8.98□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 18.2
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CAPNS1-209ENST00000590049 AARDQ4LEZ3 155 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 NOXA1Q86UR1 476 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM68Q96MH6 324 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.98□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 MSGN1A6NI15 193 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SMLR1H3BR10 107 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 MYOD1P15172 320 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R30P59541 319 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB11AP62491 216 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N2B8 174 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 NEURL2Q9BR09 285 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.97□□□□□ -0.97
CAPNS1-209ENST00000590049 U3KQ87 197 aa8.97□□□□□ -0.97
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CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6V0E1O15342 81 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TSC22D2O75157 780 aa8.96□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 C1QBP02746 253 aa8.96□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 P2RY1P47900 373 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 BLCAPP62952 87 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ECSCRQ19T08 205 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.96□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 STX12Q86Y82 276 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM8Q96KF7 97 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HYLS1Q96M11 299 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 GON7Q9BXV9 100 aa8.96□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.95□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 H3BP45 60 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHG2P01859 326 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 AMY1AP04745 511 aa8.95□□□□□ -0.98
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR8U8P0C7N1 319 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 APELAP0DMC3 54 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 NPY1RP25929 384 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2C3Q8N628 320 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 LFNGQ8NES3 379 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 ARPC5O15511 151 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 IFNA4P05014 189 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC35B1P78383 322 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-209ENST00000590049 NDPQ00604 133 aa8.94□□□□□ -0.98
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