RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	UPK2	O00526	184 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD5	O14737	125 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA21	P01568	189 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA17	P01571	189 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV2-14	P01704	120 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINE2	P07093	398 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	NQO2	P16083	231 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R31	P59538	309 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CATR1	Q13166	79 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CNIH2	Q6PI25	160 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF24	Q7RTU0	167 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB24	Q969Q5	203 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1C2	O00338	296 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	DFFB	O76075	338 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	HPRT1	P00492	218 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	AMBP	P02760	352 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CD5	P06127	495 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAO1	P09471	354 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG2	P59768	71 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC4	P59998	168 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-16	P61578	105 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CDNF	Q49AH0	187 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf4	Q9NR00	106 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN3B	Q9NY72	215 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NPY1R	P25929	384 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	WT1-AS	Q06250	92 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	IFITM5	A6NNB3	132 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSG	P08311	255 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SPP1	P10451	314 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MAL	P21145	153 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL9	P24844	172 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10A3	P58181	314 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FXYD4	P59646	89 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP5	Q01469	135 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	HACD4	Q5VWC8	232 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD1	P98161	4303 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM235	A6NFC5	223 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EIM0	57 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG7	O60262	68 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAPC5	O75971	98 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR2C	P31995	323 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP4	P55083	255 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	RCN1	Q15293	331 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF773	Q6PK81	442 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM56	Q96MV1	263 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		7.8	□□□□□ -1.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms