RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZS92 163 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM156Q8N614 296 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB125Q8N687 156 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10AC1Q8NH08 325 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PFN4Q8NHR9 129 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP1LC3AQ9H492 121 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C15orf41Q9Y2V0 281 aa0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2T8A6NH00 312 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PFDN6O15212 129 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV3-1P01715 115 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TYMSP04818 313 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BOP23527 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BBP33778 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPINK7P58062 85 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BDP58876 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BCP62807 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG9Q00887 426 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHEBQ15382 184 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST2H2BEQ16778 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LPCAT4Q643R3 524 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LPCAT3Q6P1A2 487 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BHQ93079 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CMTM5Q96DZ9 223 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIRAS2Q96HU8 199 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNBD2Q96M20 576 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BNQ99877 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BMQ99879 126 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRRT1Q99946 306 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM147Q9BVK8 224 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa0.12□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E9PCH4 1651 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0J9YY10 115 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GX78 115 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPI1P17947 270 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDELR1P24390 212 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2G2P60604 165 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED21Q13503 144 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COQ5Q5HYK3 327 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX261Q6UWH6 196 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIR17HGQ75NE6 70 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLPP5Q8NEB5 264 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR13C4Q8NGS5 318 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2T4Q8NH00 348 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN32Q96QS1 320 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC39A9Q9NUM3 307 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JPT1Q9UK76 154 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS3ST2Q9Y278 367 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 U3KQ87 197 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCCP43146 1447 aa0.11□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OCM2P0CE71 109 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYGAP11844 174 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A4P26447 101 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL12P30050 165 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARCKSL1P49006 195 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUK1Q16774 197 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AADACL3Q5VUY0 350 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf82Q6UX34 121 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM9CQ8IZT9 166 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5A1Q8NGJ0 315 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGXQ8TBF5 258 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DERL1Q9BUN8 251 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCSTAMPQ9H295 470 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C3orf18Q9UK00 162 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC11Q96J66 1382 aa0.09□□□□□ -2.39
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PQLC2LA1A4F0 135 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf71A4D174 169 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC160A6NGH7 325 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3QRK9 145 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAL4O96015 105 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNBPP62633 177 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf137Q5JT78 98 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLVS2Q5SYC1 327 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf195Q5TG92 126 aa0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZS49 121 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms