RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZN92 141 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.73□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 PRRX1P54821 245 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CCL17Q92583 94 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZZEF1O43149 2961 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 YPEL1O60688 119 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-16P61578 105 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 NEUROG1Q92886 237 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 YPEL4Q96NS1 127 aa5.73□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 YPEL2Q96QA6 119 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 FUT9Q9Y231 359 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 RRHO14718 337 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 BCL2P10415 239 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 COL8A2P25067 703 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SERF2P84101 59 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ADIPOQQ15848 244 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TDRG1Q3Y452 100 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TMEM140Q9NV12 185 aa5.73□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GW64 132 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 C15orf62A8K5M9 175 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 F2RL2O00254 374 aa5.72□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 TCF23Q7RTU1 214 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.72□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 CGB7P0DN87 165 aa5.72□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 REG1BP48304 166 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.72□□□□□ -1.49
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HERC4-211ENST00000492996 OR5B12Q96R08 314 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 BET1LQ9NYM9 111 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TACC2O95359 2948 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LRBAP50851 2863 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GV72 72 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A17O43808 307 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB8O95169 186 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 PSG1P11464 419 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 GATA4P43694 442 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 BTF3L4Q96K17 158 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.71□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.71□□□□□ -1.49
HERC4-211ENST00000492996 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C17orf100A8MU93 164 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CD99P14209 185 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RELBQ01201 579 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TCF19Q9Y242 345 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 VSTM5A8MXK1 200 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CRLF1O75462 422 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-16P04430 117 aa5.71□□□□□ -1.5
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