RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484658.1

RAB3GAP2-208, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 4

Gene RAB3GAP2, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ATP8B1	O43520	1251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DCTN3	O75935	186 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	YIF1A	O95070	293 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CDK1	P06493	297 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FGF2	P09038	288 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CRHBP	P24387	322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PCP4	P48539	62 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UNC119	Q13432	240 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q56UQ5	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGSF11	Q5DX21	431 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF773	Q6PK81	442 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KCTD9	Q7L273	389 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4S2	Q8NH73	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GGH	Q92820	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMIM19	Q96E16	107 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CIB1	Q99828	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MED4	Q9NPJ6	270 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		G3V2T6	193 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		H3BMM0	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BET1	O15155	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SOCS1	O15524	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HRAS	P01112	189 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM50B	P56557	158 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TAS2R43	P59537	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	QRFP	P83859	136 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	WT1-AS	Q06250	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TXN2	Q99757	166 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A1W2PPK0	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A1W2PS18	150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CD37	P11049	281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DCK	P27707	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CLINT1	Q14677	625 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	POU2AF1	Q16633	256 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UPK2	O00526	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRY	O14603	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC22A5	O76082	557 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HBE1	P02100	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C1QB	P02746	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR13C7	P0DN81	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HLA-DRB4	P13762	266 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CD36	P16671	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GABRB1	P18505	474 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MFAP4	P55083	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GNGT1	P63211	74 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RCN1	Q15293	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BAK1	Q16611	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ESRG	Q1W209	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DERL3	Q96Q80	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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