RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220		K7EMT4	169 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	MT-CO2	P00403	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220		Q56UQ5	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220		Q6ZRM9	215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	TXN2	Q99757	166 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ATG12	O94817	140 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	AKR1C2	P52895	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ETV6	P41212	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	MFAP4	P55083	255 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	TSPAN4	O14817	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	PRRT1	Q99946	306 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG12-208	ENST00000481220	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	IFNA17	P01571	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RETN	Q9HD89	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SNCA	P37840	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	DHODH	Q02127	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220		V9GYH0	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CHEK1	O14757	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	LYL1	P12980	280 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SPCS3	P61009	180 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	LYST	Q99698	3801 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	GNG7	O60262	68 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM50A	O95807	157 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM187	Q14656	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	MLANA	Q16655	118 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNHG12-208	ENST00000481220	RNF2	Q99496	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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