RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SIVA1O15304 175 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TOMM40O96008 361 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A16P16260 332 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ERVK11-1P61568 191 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RNF151Q2KHN1 245 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 Q5PR19 223 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 Q6P435 159 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 COLCA2A8K830 154 aa5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 RUNX1Q01196 453 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CD300CQ08708 224 aa5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.93□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.93□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GV72 72 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CRYBB3P26998 211 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 FHL1Q13642 323 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 DTX2Q86UW9 622 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CHD5Q8TDI0 1954 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM89A2RUT3 159 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RRHO14718 337 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PSMB2P49721 201 aa5.92□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS8Q16651 343 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 MSL2Q9HCI7 577 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.92□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RBAKDNA6NC62 111 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RNF152Q8N8N0 203 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 NPIPB3Q92617 1050 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF114Q8NC26 417 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 Q9H3A6 140 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PROB1E7EW31 1015 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RHODO00212 210 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SLC17A3O00476 420 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 DPM2O94777 84 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.91□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 C17orf98A8MV24 154 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 THAP8Q8NA92 274 aa5.91□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 RNF125Q96EQ8 232 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 MSGN1A6NI15 193 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 AGFG2O95081 481 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV1-44P01699 117 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CCL3L1P16619 93 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 MST1P26927 711 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.9□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0A6YYD4 124 aa5.9□□□□□ -1.46
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