RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO24O75426 580 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 AREGP15514 252 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 PAX9P55771 341 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF329Q86UD4 541 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 DTD1Q8TEA8 209 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ENY2Q9NPA8 101 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 OR13C7P0DN81 318 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 IAPPP10997 89 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 STX12Q86Y82 276 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TTC9CQ8N5M4 171 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM50AO95807 157 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CFHR3Q02985 330 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 STOML3Q8TAV4 291 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CITED1Q99966 193 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 IGSF23A1L1A6 192 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 REG1AP05451 166 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CRYGCP07315 174 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CTRB1P17538 263 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 COMMD1Q8N668 190 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 FBXL17Q9UF56 701 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TENM1Q9UKZ4 2725 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 JTBO76095 146 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CD28P10747 220 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 SULT1A1P50225 295 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF114Q8NC26 417 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 ST8SIA2Q92186 375 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 NHLH2Q02577 135 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 BSXQ3C1V8 233 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 TEX38Q6PEX7 206 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 OR5T1Q8NG75 326 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 SOX15O60248 233 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 C19orf35Q6ZS72 473 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 P2RX4Q99571 388 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXD11-201ENST00000249504 H3BP45 60 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SNCAP37840 140 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HTR2BP41595 481 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HBG1P69891 147 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HBG2P69892 147 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF266Q14584 549 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 BAP18Q8IXM2 172 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 CST7O76096 145 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV1-40P01703 118 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 IGHG4P01861 327 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ELANEP08246 267 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 KLK9Q2XQG4 91 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 OR1P1Q8NH06 330 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 H3BUA1 57 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 DFFBO76075 338 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 BRI3O95415 125 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 NPY1RP25929 384 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 MFAP2P55001 183 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 FOXE3Q13461 319 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf83Q53S99 150 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD11-201ENST00000249504 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.1 ms