RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RGS5O15539 181 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 APOA1P02647 267 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RCVRNP35243 200 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 AKR1C2P52895 323 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MFAP2P55001 183 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PRR20EP86478 221 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PRR20CP86479 221 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PRR20DP86480 221 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PRR20BP86481 221 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PRR20AP86496 221 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PMS2P11Q13670 270 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 POU2AF1Q16633 256 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM16LQ309B1 348 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GPR107Q5VW38 600 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 OR5B3Q8NH48 314 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GPX8Q8TED1 209 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TSC22D3Q99576 134 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 DBX1A6NMT0 343 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 A8MWP6 167 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GNG7O60262 68 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 IFNA17P01571 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SNCAP37840 140 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SP6Q3SY56 376 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 OR2C3Q8N628 320 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35G3Q8N808 338 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 IL17DQ8TAD2 202 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 AP3S1Q92572 193 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MARC2Q969Z3 335 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ENY2Q9NPA8 101 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 COPZ2Q9P299 210 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 KLK11Q9UBX7 282 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 LCE6AA0A183 80 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf65A6NEN9 183 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 C15orf61A6NNL5 157 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 JTBO76095 146 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MT-CO2P00403 227 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 CD3DP04234 171 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 NAT1P18440 290 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MFAP4P55083 255 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 PIGPP57054 158 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB135Q30KP9 77 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 OR52I2Q8NH67 350 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 CMTM3Q96MX0 182 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 OR4C46A6NHA9 309 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 K7EIM0 57 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFA4O00483 81 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RAB3DO95716 219 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 FGF2P09038 288 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ADMP35318 185 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ETV6P41212 452 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 APOC4P55056 127 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 GPR141Q7Z602 305 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 OR1P1Q8NH06 330 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SEC22AQ96IW7 307 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-209ENST00000480420 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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