RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 RNF2Q99496 336 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 NMSQ5H8A3 153 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 TCF23Q7RTU1 214 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 LRTM2Q8N967 370 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 CACNG5Q9UF02 275 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.72□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 IAPPP10997 89 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 TNFSF4P23510 183 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 CDKN1AP38936 164 aa14.72□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 P2RX4Q99571 388 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 CCL3L1P16619 93 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 GNLYP22749 145 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.72□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 AGMATQ9BSE5 352 aa14.72□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.72□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 CD3EP07766 207 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 MZT1Q08AG7 82 aa14.71□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.71□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.71□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 OCIAD2Q56VL3 154 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.71□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 S1PR2O95136 353 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 GATA4P43694 442 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 HCFC1P51610 2035 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 CFHR2P36980 270 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 CALYQ9NYX4 217 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PPR1 153 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.7□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 VDAC1P21796 283 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 BMI1P35226 326 aa14.69□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 PRB1P04280 392 aa14.69□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.69□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA45Q537H7 98 aa14.68□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.68□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 TAS2R30P59541 319 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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PDE4D-204ENST00000358923 TMEM178BH3BS89 294 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 IFNA1P01562 189 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF1AP19438 455 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 BET1LQ9NYM9 111 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 CHD6Q8TD26 2715 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0U1RQK1 487 aa14.67□□□□□ -0.06
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