RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	IL17D	Q8TAD2	202 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MOB3A	Q96BX8	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CMTM3	Q96MX0	182 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	NEURL2	Q9BR09	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	EHF	Q9NZC4	300 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PPP5D1	E7EU14	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301		E7EUB6	86 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PTHLH	P12272	177 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MYOD1	P15172	320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CBLN1	P23435	193 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CD81	P60033	236 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR51H1	Q8NH63	302 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TSC22D3	Q99576	134 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	RYR3	Q15413	4870 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF320	A2RRD8	509 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GPR31	O00270	319 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SNAPC5	O75971	98 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	S1PR2	O95136	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	APOA1	P02647	267 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	RLN1	P04808	185 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CLEC3B	P05452	202 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	RFX2	P48378	723 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GUCA2B	Q16661	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR5B3	Q8NH48	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PRND	Q9UKY0	176 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	KRAS	P01116	189 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PMP2	P02689	132 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	REG1A	P05451	166 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	FCER2	P06734	321 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	SERPINE2	P07093	398 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	OR13C7	P0DN81	318 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GPR183	P32249	361 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	RCVRN	P35243	200 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	HRH1	P35367	487 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	UCP3	P55916	312 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	PLET1	Q6UQ28	207 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	GPX8	Q8TED1	209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	AP3S1	Q92572	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM56	Q96MV1	263 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NPC1-208	ENST00000590301	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		5.72	□□□□□ -1.49

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