RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZN92 141 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 PSG1P11464 419 aa12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF787Q6DD87 383 aa12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 ZNF596Q8TC21 504 aa12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 COX5AP20674 150 aa12.49□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.49□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 OOEPA6NGQ2 149 aa12.48□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 HES4Q9HCC6 221 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.48□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZWC4 215 aa12.48□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CTIF-205ENST00000587860 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.47□□□□□ -0.41
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CTIF-205ENST00000587860 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 BTF3L4Q96K17 158 aa12.46□□□□□ -0.42
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.45□□□□□ -0.42
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CTIF-205ENST00000587860 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.45□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.45□□□□□ -0.42
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CTIF-205ENST00000587860 CLDN14O95500 239 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 HBG1P69891 147 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 HBG2P69892 147 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 Q8TCH9 128 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 CCL13Q99616 98 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 ZNF737O75373 536 aa12.44□□□□□ -0.42
CTIF-205ENST00000587860 MMP23AO75900 390 aa12.44□□□□□ -0.42
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