RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	S1PR2	O95136	353 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CD36	P16671	472 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MAS1L	P35410	378 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TFPI2	P48307	235 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFRP1	Q13795	201 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	AHSA2	Q719I0	299 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4S2	Q8NH73	311 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3C	Q96E17	227 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPO	Q9BU64	300 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	THYN1	Q9P016	225 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	APLN	Q9ULZ1	77 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ERICH4	A6NGS2	130 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5B	O43169	146 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DIRAS3	O95661	229 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYGC	P07315	174 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF735	P0CB33	412 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	GADD45A	P24522	165 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP1	P43487	201 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN12	P56749	244 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T8	A6NH00	312 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511		E7EUB6	86 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A2	O00624	439 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TGOLN2	O43493	480 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK1	P06493	297 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM187	Q14656	261 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA2	Q9UM82	520 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH2	Q9P225	4427 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PKHD1	P08F94	4074 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVY2	172 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R2N4	97 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A5	O76082	557 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	HRAS	P01112	189 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB3	P16520	340 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-G	P17693	338 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM203	Q969S6	136 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	MND1	Q9BWT6	205 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GW64	132 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL6IP5	O75915	188 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	UCHL1	P09936	223 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX1	Q16384	188 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB22A	Q9UL26	194 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA4	O00483	81 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	YIF1A	O95070	293 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DMB	P28068	263 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	PAFAH1B2	P68402	229 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511		Q56UQ5	140 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	HES5	Q5TA89	166 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SKAP2-209	ENST00000497511	UFD1	Q92890	307 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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