RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TIMD4Q96H15 378 aa13.56□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.56□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.56□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 COLCA2A8K830 154 aa13.55□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.53□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A17O43808 307 aa13.53□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PR64 198 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PRV1 198 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 C22orf46C9J442 243 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RBP4P02753 201 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 RAB31Q13636 194 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 C2orf83Q53S99 150 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 MOB3BQ86TA1 216 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 DTX2Q86UW9 622 aa13.52□□□□□ -0.24
TOM1-216ENST00000492723 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.52□□□□□ -0.24
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TOM1-216ENST00000492723 B2MP61769 119 aa13.52□□□□□ -0.25
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TOM1-216ENST00000492723 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.51□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 FNDC10F2Z333 226 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 PAGE4O60829 102 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 LGALS7P47929 136 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PN81 502 aa13.5□□□□□ -0.25
TOM1-216ENST00000492723 ZNF727A8MUV8 499 aa13.5□□□□□ -0.25
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